同样禀承于用最小的动乱解决问题这样一个思路，一九五六年三月，西贡的越南军事学院正式开张了，夺取军权，消除派系，进行整编的大戏拉开了帷幕。
为了保证在南越统一军令，整编军队行动的顺利实施，南洋联邦和美国不惜以破坏日内瓦规定为代价。两国出动了联合舰队，包括美国第七舰队的一艘航母，南洋联邦的两艘直升机航母，停靠于西贡港口，对南越军队中可能的异动进行监视和威慑。
将校进修班一共开展了三期，每期时间为半个月，军校的教官全部由南洋联邦和美国派遣。其实所谓进修，不过是将这些南越将领调离军队，暂时脱离军权。而经过观察和考核，确有能力者将被留用，但却是重新分配，不再会回到自己熟悉的部队；而庸碌无能者则被暂时安置到总参谋部，等待军队整编完成后，再将这些人另行处理。
两个月后，原来拥有五个师的南越国民军的高级将领以师为单位几乎全部轮换了一遍，一些原来由南洋联邦培训的越南军官渗透了进去，开始掌控兵权。紧接着，军事学院又开始了尉级军官***，照旧是考察、甄选、打乱分配，无能的军官被强制退役，更多的新军官则进入了军队。紧接着是军队士兵的筛选和整编，年龄、体力和技能不合格者退役，五个师最后只剩下了四个师。
……………
当然，事情总不会是一帆风顺，但一些小小的波浪却无法影响到大局。到一九五六年七月，南越军队系统终于被整体清洗了一遍。几起小骚乱被无情地镇压下去，而最大的反抗行动是原步兵第三师师长阮庆发起的，但当呼啸而来的美国轰炸机将他的司令部夷为平地时，这位死里逃生的少将立刻宣布服从政府决定，并立即辞职，和家人跑进了法国大使馆寻求庇护。
但南越政府不准备放过这个杀鸡儆猴的机会，联合美国和南洋联邦向法国人施加了强大压力，终于迫使法国人交出了阮庆。这位看不清形势的老兄立刻被抓进监狱，经过简短的军事法庭审判，以叛国罪处以死刑。
震慑是必须的，清洗是必要的，此事过后，南越政府和首相潘光诞的威信算是彻底树立起来。军队的彻底掌控还需要一些时间，但已经无碍于潘光诞借助于军队开始对南越的警政系统进行另一次清洗了。而随着国家暴力机器的掌握，南越政府仿效南洋联邦成立了廉政公署，反腐力度也突然猛烈起来，大批前政府官员和涉嫌分子被秋后算账，纷纷入狱。
历史往往是从一个顶峰坠入一个谷底，或从一个谷底升至顶峰，盛极而衰，乱而后治，便体现出这种辩证的思想和结果。南越能在短时间内平稳下来，正是乱而后治的体现。饱受战乱、饥饿、贫困所折磨的民众，人心思定，对生存的需求超过了其他诉求。而且这个时候想安定人心，所花费的代价是最小的，只要当权者体现出这种意愿，并且给民众生活以实际的改变，哪怕很微小，也会得到民众的拥护。就象对一个乞丐来说，给他一个馒头，他会认为是幸福的事情；而对一个富翁来说，山珍海味也未必让他满意。
短短的两年时间，在令人眼花缭乱的精巧布局下，在外援源源不断的供给下，南越形势发生了翻天覆地的变化。原来尖锐的社会矛盾已经得到了极大的缓解，治安恶化和骚乱不断也得到了有效的控制，政府的威信和潘光诞的声誉也提高到一个新的阶段。当然，形势的变化只有身在其中者，才会有更直接的感触。
驻西贡的美国大使泰勒向国务院的报告中说到：“南越最近的一系列变化是足以令人感到欣慰的，一个强有力的政府已经越来越明确地出现在我们眼前，这是符合美国利益的。对此，我只能说从中学到了很多的东西，并认为以前给法国人的援助因为法国人的愚蠢并没有起到应有的作用。我国只从军事和武器装备上考虑事情，显然是偏颇的……”
法国驻西贡大使埃维尔则无奈地在自己的报告中写道：“显然，南洋联邦在越南的影响越来越大，即便是美国，也有稍居其后。不可否认，南洋联邦的策划是周密的，准备是充分的，措施是切实可行的，南越政府正在越来越稳固地控制局势，越来越得到民众的支持和欢迎。如果当初我们不是单纯地只从军事上投入，或许会避免奠边府的悲剧，或许会让法兰西的荣誉继续保持……”
第一百八十八章南越的变化
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